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【产品组合】Norgen全血采集管+血浆/血清RNA和DNA纯化

发布者:开元(SPORTS)体育在线登录 科技    发布时间:2023-02-13     
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血液含有细胞和无细胞游离核酸。当细胞死亡时,细胞内的物质会被释放出来,包括 DNA和RNA。血液中不受保护的核酸被核酸酶消化。与蛋白质结合和包含在外泌体内的DNA和RNA被保护不被降解——被称为无细胞循环DNA/RNA(cf-DNA/cf-RNA)。

(1)在血浆中发现cf-DNA/cf-RNA;

(2)表现为正常的cf-DNA、循环肿瘤 DNA(ct-DNA)或cf-RNA;

(3)癌症检测的重要生物标志物包括ct-DNA和cf-RNA;

(4)通常以低丰度存在:1-100 pg/uL。

 

Norgen全血采集管

 

市面上血样通常收集在含EDTA(抗凝剂)等的收集管中,但这需要在装运前立即处理或冷冻。

痛点:

(1)昂贵的干冰运输;

(2)因延误造成珍贵样品损失;

(3)试验样本收集的地域限制。

Norgen 的防腐剂(保护剂)允许在室温下将DNA和RNA保存在一管中,以便储存和运输——长达30天。开元(SPORTS)体育在线登录 科技作为专业的生命科学领域解决方案供应商,为您推荐独家代理Norgen Biotek品牌的全血采集管:cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes (#63950/Dx63950)

 

产品名称及描述货号规格产品说明
cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes6395050 Tubes仅用于科研,不可用于临床诊断
cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes DxDx6395050 Tubes带CE-IVD标志,符合欧盟认证98/79/EC

 

优势:

(1)在室温下将cf-DNA和cf-RNA保存30天;

(2)在室温下保存 CTCs 14 天;

(3)无甲醛 = 无DNA交联;

(4)防止血细胞凋亡和基因组DNA片段化;(*防止血浆被基因组DNA污染)

(5)防止溶血和血浆污染;(*防止溶血=运输后无血浆损失)

(6)抽真空以在10mL PET管中抽取8.4mL血液;

(7)多个关键应用:诊断(血液生物标志物)、SNP 发现和基因分型、NIPT(无创产前检测)、表观遗传研究、药物基因组学研究、液体活检(癌症检测和监测)和下一代测序(基因组和转录组)。

(8)相比于其他竞争对手:

痛点:

① 其他竞争对手保存所有核酸、外泌体和CTCs需要多个管;而Norgen可以保存所有的核酸,外泌体和CTCs;

② 用其他管的保存时间更短;而Norgen的全血收集管在室温下将cf-DNA和cf-RNA保存30天;

③ 用其他管在高温(最高37℃)保存时间短;而Norgen的全血收集管在37°C下保存长达8天。

 

血浆/血清RNA和DNA纯化

 

目前DNA和RNA的常见的纯化方法是使用苯酚 : 氯仿硅胶色谱柱

(1)苯酚 : 氯仿——捕获总RNA,价格便宜,但苯酚是抑制剂,需要进一步清理;苯酚和氯仿是有害的等;

(2)硅胶色谱柱——不是RNA的最佳选择(偏向于结合较大的片段),也可能需要使用载体RNA等;

 

痛点:

① 酚类物质是抑制剂,在下游应用前需要进一步清除;

② 苯酚和氯仿是有害的;

③ RNA载体不适合NGS(例如RNA-seq);

④ 其它方法会使得RNA多样性缺失。

 

Norgen Biotek品牌专利性的纯化方法和技术:碳化硅色谱柱(Silicon Carbide)

优势如下:

(1)无大小偏差的RNA分离;

(2)捕获真正的总 RNA,包括小RNA(加上microRNA和siRNA),无需 RNA 载体或苯酚;

(3)提供2种形式:

柱提法(Column)

1.a) 用于较小的样品上样量;

2.b) 样品通过预先装有树脂的色谱柱;

浆液形式(Slurry)

1.a) 用于更大的样品上样量;

2.b) 样品与悬浮在缓冲液中的树脂混合;

(4)两种形式均可捕获血浆中的所有cf-DNA和cf-RNA(宿主,病毒等)。

 

可以手动纯化血浆/血清中的cf-DNA和cf-RNA,也可以使用自动化试剂盒与各种开放式自动化机器/液体处理设备兼容。可用于在一次洗脱中纯化仅cf-DNA,仅cf-RNA,cf-DNA和cf-RNA,或在单独洗脱中同时纯化cf-DNA和cf-RNA。

 

举例如下:

产品名称货号说明
Plasma/Serum Cell-Free Circulating DNA Purification Micro Kit55500一次洗脱中仅cf-DNA
Plasma/Serum RNA Purification Mini Kit55000一次洗脱中仅cf-RNA
Plasma/Serum Cell-Free Circulating and Viral Nucleic Acid Purification Mini Kit56300一次洗脱中cf-DNA和cf-RNA
Plasma/Serum cfc-DNA/cfc-RNA Advanced Fractionation Kit68300在单独洗脱中同时纯化cf-DNA和cf-RNA


血浆/血清RNA纯化的主要亮点:

(1)分离所有大小的循环和外泌体RNA,包括microRNA;

(2)不含有害苯酚或氯仿;

(3)不使用载体RNA;

(4)结合和洗脱所有RNA,无论大小或GC含量如何,无偏差;

(5)在35-40分钟内纯化高质量RNA;

(6)纯化的RNA不含抑制剂,适用于各种下游应用,包括二代测序(如small RNA-seq)。

 

Tips:低丰度RNA的定量

(1)无法使用NanoDrop进行定量。需要其它方法。

(2)请参阅Application Note 47 - Revised Guidelines for RNA Quality Assessment for Diverse Biological Sample Input.

 

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